1: החלף את אספקת הניסוי בזמן

הגדר (NTC) בקרה שלילית וחזור עליו פעמים רבות.לאחר שנמצא כי יש זיהום מוצר PCR במעבדה, החלף את כל אספקת הניסוי בזמן.כגון: לדלל מחדש ולהכין את הפריימרים, לעקר מחדש את קצה הפיפטה, שפופרת EP, ddH2O וכו', להחליף לפיפטה חדשה ולשאול זמנית מעבדות אחרות לביצוע ניסויי PCR.המעבדה המזוהמת תאוורר ותוקרן בקרניים אולטרה סגולות עד לביטול זיהום המוצר PCR לפני המשך הניסוי.

2: הארכת זמן חשיפת UV

ראוי לציין שכדי להסיר זיהום DNA, יש להאריך את הקרינה האולטרה סגולה הרגילה ב-2 שעות מהרגיל.למרות זאת, ההשפעה של קרינת UV על הסרת שברים קטנים (מתחת ל-200bp) של זיהום DNA עדיין לא טובה.

אורך גל אולטרה סגול (ננומטר) הוא בדרך כלל 254/300 ננומטר, וזה מספיק כדי להקרין במשך 30 דקות.יש לציין כי בעת בחירת UV לסילוק הזיהום של שאריות תוצרי PCR, יש להתחשב באורך תוצר ה-PCR ובהתפלגות הבסיסים ברצף המוצר.קרינת UV יעילה רק עבור שברים ארוכים מעל 500 bp, ויש לה השפעה מועטה על שברים קצרים.

במהלך הקרנת UV, בסיסי הפירימידין במוצר ה-PCR יווצרו דימרים.דימרים אלו יכולים להפסיק את ההרחבה, אך לא כל הפירימידינים בשרשרת ה-DNA יכולים ליצור דימרים, וקרינת UV יכולה גם לשבור את הדימרים..מידת היווצרות הדימר תלויה באורך הגל UV, סוג הפירימידין דימר ורצף הנוקלאוטידים הסמוכים לאתר הדימר.לכן, אם השברים המוגברים ב-PCR קטנים, מומלץ להשתמש במערכת זיהום המוצר נגד PCR של UNG.

3: חומרי זיהום DNA בשימוש נפוץ

אירוסולים נוצרים בקלות כאשר מוסיפים פיפטות, שקשה להימנע ממנו, והוא ישקע במהירות.לכן, אין ספק שזאת בחירה טובה להשתמש תדיר בחומרי זיהום מיוחדים של DNA כדי למנוע את התפשטות זיהום הדנ"א.

4: השתמש במערכת נגד זיהום UNG

לאחר הסרת זיהום המוצר PCR, מעבדת הבדיקה יכולה להשתמש במערכת UNG anti-PCR זיהום המוצר כדי למנוע זיהום מוצר PCR.במעבדות כלליות, ניתן לבצע מחיצות ניסוי פשוטות, להפריד בקפדנות את תחום מוצר ה-PCR מתחומים אחרים, לקבוע כללים ותקנות מעבדה מסוימים ולערוך הדרכה רלוונטית למניעת התרחשות של זיהום מוצר PCR.

המלצות: הקמת מעבדת PCR סבירה, שמירה על סביבת PCR טובה, גיבוש נהלי תפעול PCR סטנדרטיים וטיפוח המודעות התפעולית הקפדנית של הנסיינים הם המפתחות למניעה או הפחתת הזיהום של ניסויי PCR.