ב-14 בדצמבר 2020 דיווחה בריטניהגרסה של SARS-CoV-2 של דאגה (VOC), שושלת B.1.1.7,המכונה גם VOC 202012/01 או 20I/501Y.V1.*לפי הערכות, גרסה B.1.1.7 הופיעה בספטמבר2020 והפך במהרה לדומיננטי במחזורגרסה של SARS-CoV-2 באנגליה (1).B.1.1.7 היהזוהה ביותר מ-30 מדינות, כולל ארצות הברית.כפי שמיום 13 בינואר 2021, כ-76 מקרים של B.1.1.7 היוזוהה ב-12 מדינות בארה"ב.שורות ראיות מרובותמצביעים על כך ש-B.1.1.7 מועבר בצורה יעילה יותר ממה שישגרסאות אחרות של SARS-CoV-2 (1–3).המסלול המעוצב שלגרסה זו בארה"ב מציגה צמיחה מהירה בתחילת 2021,הופך לגרסה השולטת במרץ.מוּגדָלהעברת SARS-CoV-2 עלולה לאיים על טיפול רפואי מתוחמשאבים, דורשים יישום מורחב וקפדני יותרשל אסטרטגיות בריאות הציבור (4), ולהגדיל את האחוז שלחסינות האוכלוסייה הנדרשת לשליטה במגפה.לְקִיחָהצעדים להפחתת השידור כעת יכולים להפחית את הפוטנציאלהשפעה של B.1.1.7 ולאפשר זמן קריטי להגברת החיסוןכיסוי.באופן קולקטיבי, מעקב גנומי משופרבשילוב עם המשך ציות לציבור יעילאמצעים בריאותיים, לרבות חיסון, ריחוק פיזי,שימוש במסכות, היגיינת ידיים, בידוד והסגר, יהיהלהיות חיוני להגבלת התפשטות SARS-CoV-2, הנגיףשגורם למחלת נגיף הקורונה 2019 (COVID-19).אסטרטגיבדיקות של אנשים ללא תסמינים אך בסיכון גבוה יותר לזיהום, כגון אלה שנחשפו ל-SARS-CoV-2 או שיש להםמגע בלתי נמנע תכוף עם הציבור, מספק אחרהזדמנות להגביל את ההתפשטות המתמשכת.

מעקב גנומי עולמי ושיתוף מהיר בקוד פתוחעיבוד של רצפי גנום נגיפי הקלה כמעט בזמן אמתזיהוי, השוואה ומעקב אחר SARS-CoV-2 מתפתחגרסאות שיכולות להודיע ​​למאמצי בריאות הציבור לשלוט עלמגפה.בעוד כמה מוטציות בגנום הנגיפילהגיח ואז להתרחק, אחרים עשויים להעניק יתרון סלקטיביתג לגרסה, כולל יכולת העברה משופרת, כךוריאנט כזה יכול להשתלט במהירות על וריאנטים אחרים במחזור.

בתחילת המגיפה, גרסאות של SARS-CoV-2 המכילותהמוטציה D614G בחלבון הספייק (S) שמתגברתתאוות הקישור לקולטן הפכה במהירות דומיננטית ברביםאזורים גיאוגרפיים (5,6).בסוף הסתיו 2020, מספר מדינות דיווחו על איתורגרסאות SARS-CoV-2 שמתפשטות ביעילות רבה יותר.בנוסףלגרסה B.1.1.7, גרסאות בולטות כוללות את B.1.351שושלת זוהתה לראשונה בדרום אפריקה וזוהתה לאחרונהB.1.1.28 subclade (שם"עמ' 1”) זוהה בארבעה מטייליםמברזיל במהלך הקרנה שגרתית בהאנדה (טוקיו)שדה תעופה.§ גרסאות אלה נושאות קבוצת כוכבים של מוטה גנטיתכולל בתחום מחייב קולטן חלבון S,שהוא חיוני לקשירה לתא המארח אנגיוטנסין-המרת קולטן לאנזים-2 (ACE-2) כדי להקל על הנגיףכְּנִיסָה.עדויות מצביעות על כך שמוטציות אחרות נמצאו באלהגרסאות עשויות להעניק לא רק יכולת העברה מוגברת אלאעשוי גם להשפיע על הביצועים של אבחון כלשהו בזמן אמתתעתיק הפוך–תגובת שרשרת פולימראז (RT-PCR)מבחני¶ ולהפחית את הרגישות לנטרול נוגדנים(2,3,5–10).דיווח מקרה אחרון תיעד את המקרה הראשון שלהדבקה חוזרת של SARS-CoV-2 בברזיל עם גרסה של SARS-CoV-2שהכיל את המוטציה E484K,** שהוכחהלהפחתת הנטרול על ידי סרה הבראה וחד שבטינוגדנים (9,10).

דוח זה מתמקד בהופעתה של הגרסה B.1.1.7בארצות הברית.נכון ל-12 בינואר 2021, גם לאB.1.351 ולא גרסאות P.1 זוהו ב-ארצות הברית.למידע על SARS-CoV-2 המתהווהוריאנטים של דאגה, CDC מתחזקת דף אינטרנט המוקדש אליומתן מידע על גרסאות SARS-CoV-2 המתפתחות.††

 שושלת B.1.1.7 (20I/501Y.V1)

וריאנט B.1.1.7 נושא מוטציה בחלבון S(N501Y) המשפיעה על הקונפורמציה של קישור קולטןתְחוּם.לגרסה זו יש 13 מוטציות אחרות שמגדירות שושלת B.1.1.7 (טבלה), כמה מהן נמצאות בחלבון S,כולל מחיקה בעמדות 69 ו-70 (del69–70) זההתפתח באופן ספונטני בגרסאות אחרות של SARS-CoV-2 והואהשערה להגביר את יכולת ההעברה (2,7).המחיקהבעמדות 69 ו-70 גורם לכשל מטרת S-gene (SGTF)ב-RT-PCR אחד לפחות–בדיקת אבחון מבוססת (כלומר, עםמבחן ThermoFisher Taq Path COVID-19, B.1.1.7 variנמלה וגרסאות אחרות עם ה-del69–70 מייצרים שליליתוצאה עבור יעד S-gene ותוצאה חיובית עבור השניים האחריםמטרות);SGTF שימש כמיופה כוח בבריטניהלזיהוי מקרים ב.1.1.7 (1).שורות ראיות מרובות מצביעות על כך ש-B.1.1.7 הוא יותרמועבר ביעילות בהשוואה ל-SARS-CoV-2 אחריםגרסאות שמסתובבות בבריטניה.אזורי בריטניה עםלשיעור גבוה יותר של רצפי B.1.1.7 הייתה מגיפה מהירה יותרגידול מאשר בתחומים אחרים, האבחונים עם SGTF עלומהר יותר מאבחונים שאינם SGTF באותם אזורים, ואשיעור גבוה יותר של אנשי קשר נדבקו בחולי אינדקסעם זיהומים B.1.1.7 מאשר על ידי חולי אינדקס שנדבקו בגרסאות אחרות (1,3).לגרסה B.1.1.7 יש פוטנציאל להגדיל את הפאן בארה"במסלול דמי בחודשים הקרובים.כדי להמחיש את האפקט הזה,פותח מודל תאים פשוט עם שתי גרסאות.השכיחות הנוכחית בארה"ב של B.1.1.7 בקרב כל המסתובביםוירוסים אינם ידועים, אך מניחים שהם פחות מ-0.5% בהתבסס עלמספר מוגבל של מקרים שזוהו ונתוני SGTF (8).להמודל, ההנחות הראשוניות כללו שכיחות B.1.1.7של 0.5% מבין כל הזיהומים, חסינות SARS-CoV-2 מפניזיהום קודם של 10%–30%, רבייה משתנה בזמןמספר (R t ) של 1.1 (העברה מופחתת אך גוברת)או 0.9 (ירידה בשידור) עבור גרסאות נוכחיות, ושכיחות מדווחת של 60 מקרים לכל 100,000 נפשות ביום ב1 בינואר 2021. הנחות אלו אינן מייצגות במדויקכל מיקום בודד בארה"ב, אלא להצביע על הכללה שלתנאים הנפוצים בכל הארץ.השינוי ב-R t נגמרזמן הנובע מחסינות נרכשת והגברת ה-prevaרנס של B.1.1.7, עוצבה, כאשר ה-B.1.1.7 R t הונחהלהיות קבוע פי 1.5 מה-R t של גרסאות הנוכחיות, בהתבסס עלהערכות ראשוניות מבריטניה (1,3).לאחר מכן, הודגם ההשפעה הפוטנציאלית של החיסוןבהנחה ש-1 מיליון מנות חיסון ניתנו לכליום שמתחיל 1 בינואר 2021, וחסינות של 95%.הושג 14 ימים לאחר קבלת 2 מנות.באופן ספציפי,חסינות מפני זיהום עם גרסאות נוכחיות או עםהונחה גרסה B.1.1.7, אם כי האפקטיביות ומשך ההגנה מפני זיהום נותר לא ברור,כי אלה לא היו נקודת הסיום העיקרית של ניסויים קלינייםעבור חיסונים ראשוניים.במודל זה, שכיחות B.1.1.7 נמוכה בהתחלה, אך בגללזה מועבר יותר מאשר גרסאות הנוכחיות, זה מציגצמיחה מהירה בתחילת 2021, והפכה לשונות השולטותנמלה במרץ (איור 1).בין אם העברת זרםהווריאציות גדלות (R t התחלתי = 1.1) או יורדות לאט(R t התחלתי = 0.9) בינואר, B.1.1.7 מניע שינוי מהותיבמסלול השידור ושלב חדש של אקספוננציאליצְמִיחָה.עם חיסון המגן מפני זיהום, המסלולי מגיפה מוקדמים אינם משתנים ו-B.1.1.7 התפשטעדיין מתרחש (איור 2).עם זאת, לאחר ש-B.1.1.7 הופך ל-הגרסה הדומיננטית, ההעברה שלו הופחתה באופן משמעותי.השפעת החיסון על הפחתת ההעברה בסמוךהטווח היה הגדול ביותר בתרחיש שבו הייתה השידורכבר יורד (R t התחלתי = 0.9) (איור 2).מאמצים מוקדמים שיכול להגביל את התפשטות וריאנט B.1.1.7, כגון אוניברסלי והגברת הציות לאסטרטגיות הפחתת בריאות הציבור,יאפשר יותר זמן לחיסון מתמשך כדי להשיג גבוה יותרחסינות ברמת האוכלוסייה.

דִיוּן

נכון לעכשיו, אין הבדל ידוע בתוצאות הקליניותקשור לגרסאות SARS-CoV-2 המתוארות;למרות זאת,קצב שידור גבוה יותר יוביל ליותר מקרים, יגדלמספר האנשים הכולל הזקוקים לטיפול קליני, מחמירלהטיל את העומס על מערכת בריאות כבר מתוחה,וכתוצאה מכך מקרי מוות נוספים.המשך מעקב גנומילזהות מקרים B.1.1.7, כמו גם הופעת מקרים אחריםוריאנטים של דאגה בארצות הברית, חשוב עבורתגובה לבריאות הציבור של COVID-19.ואילו תוצאות ה-SGTFיכול לסייע בזיהוי מקרים פוטנציאליים של B.1.1.7 שניתן לאשרעל ידי רצף, זיהוי גרסאות עדיפות שאינן מוצגותSGTF מסתמך באופן בלעדי על מעקב מבוסס רצף.